咖啡色边牧是怎么来的？
边境牧羊犬的毛色在所有犬种中属于最多，因为除白色（Border Collie的毛色原则上不该为纯白色）外，其他犬类不能出现的毛色几乎都会在Border Collie身上发现。最常见的应该是黑白两色或三色。三色的毛色为黑、白、棕红三色，这种毛色在Border Collie称为Tricolor。棕红色的部位通常仅限于口吻周围、下腹、小腿及眼眶周边，Border Collie品种书中对于Tricolor的描述为”a tricolor is Black and Tan marked on a white background”。换句话说，如果口吻周边是黑色而非棕色，则不属于三色而是二色黑。
浅褐色border collie
比较特别的是Merle。Merle字面上翻成英语即为斑驳的意思。Merle Border Collie有蓝merle及褐merle两种，蓝merle的毛色为深色斑点（黑色或深褐色）错落在浅灰色的毛底上，斑点的大小及形状几乎没有规律，通常头比较深色，身上较浅，褐merle则是褐色斑点分布在奶酪色的毛底上。Merle的毛色在Border Collie中比较少见。由于Merle是显性色，如果一只犬是Merle色，则必定有Merle犬作其直系祖辈。Merle色是遗传上的缺陷，如果让两只Merle相配，一定会出生毛色称为”cabbage patch”的幼犬，”cabbage patch”字义上讲为卷心菜田的意思，这种犬的毛色是完全没有色点的白色毛，通常并伴有青光眼、白内障或失聪（有80%几率失聪）等现象，因此这种犬是绝不能再用于繁衍后代的。边牧的褐merle在其他国家很少见，多流行于日本。
白色斑纹的毛色在Border Collie中也相当独特。（斑纹（liver marking）是指该部位应为黑色的犬，但其所处地域气候条件影响，该部位毛色为棕色。）在其他国家不太见得到，在日本较为流行，毛的背景色为白色，黑色或红棕色毛色以斑点、圆环、线纹等各种形式、或各种组合方式散布在白毛的背景上。斑纹色往往比较受女士喜爱。
边境牧羊犬的毛长分为长毛、短毛两种，长毛犬背部毛稍短，腹下毛较长，短毛犬全身毛长约在1cm左右，边境牧羊犬毛质有粗毛、软毛之分，通常粗毛犬为长毛，软毛犬多为短毛，毛质粗细通常随血统来源国家不同或同国不同场犬而有较大差别。